دراسة قناة البوتاسيوم (K)

  تعتبر قناة البوتاسيوم من البروتينات الغشائية ، لها عدة أدوار حيث تسمح بإفراز شوارد البوتاسيوم دون تغيير في بنيتها ، ولفهم العلاقة بين بنية قناة البوتاسيوم 

 ووظيفتها  ندرسها باستعمال برنامج Rastop.

   التعرف على بنية قناة البوتاسيوم :

 افتح ملف بروتين(1BL8) ثم اتبع الخطوات التالية:

 Fichier /Ouvrir (1BL8) :   انقر على

  ثم انقر على الزر    وباستعمال تعليمة Atomes /Colorer par/Chaine تتلون القناة حسب السلاسل المكونة لها

 قم بالتحريك الجزيئة تتحصل على الوجه الجانبي والعلوي  للقناة كما هو موضح في الشكلين المواليين:  

 الوجه العلوي للقناة                         

                    الوجه الجانبي للقناة                                 

  نلاحظ من الشكلين أن قناة البوتاسيوم تتكون من أربعة سلاسل ببتيدية يظهر في وسطها كرة حمراء تتمثل في شاردة البوتاسيوم.

    تحديد موضع البوتاسيوم في القناة :

انقر على Rubans /Afficher seul/Rubans /Caricatures ثم انقر على الزر

  تظهر لك نافذة  Sélection d'atomes  اكتب عليها (k) تتحصل

على الشكل المقابل:

    نلاحظ من الشكل  يتواجد في قناة  البوتاسيوم ثلاثة ذرات من البوتاسيوم

. ملونة الأحمر 

    تحديد الأحماض الأمينية التي تساهم في مرور البوتاسيوم :

  لتحديد موقع الأحماض الأمينية يجب تحديد المركز ثم تحديد القطر الذي يشمل على الذرات المحيطة به نعتبر أن (K) هو المركز .

 بإتباع الخطوات التالية : انقر على الزر ثم علىEditer /Commande

 اكتب فيها  (restrict within 8.0,K)  ثم انقر علىPropriétés/Neutres

 ، لتحديد الأحماض الأمينية المتعادلة  وبالنقر على الزر اختر اللون الأخضر ، تتحصل على الشكل المقابل : نلاحظ في الشكل أن ثلاثة ذرات من (K) ممثلة بلون وردي

 والذرة الممثلة باللون الأحمر عبارة عن ماء .

الأحماض الأمينية التي تساهم في مرور البوتاسيوم هي أحماض متعادلة.