Rastop تعريف أ زرار العرض Rastop تعليمات أساسيات استعمال البرنامج تحميل ملفات البروتينات تحميل البرنامج  

مواقع مكملة   Chime استعمال برنامج لوحة التحكم

  الصفحة الرئيسية     

دراسة النظام  الضوئي الأولPSI          

 

النظام الضوئي الأولPSI معقد بروتيني يعمل على إرجاع + NADP  إلى NADPH  ، يختلف عن النظام الضوئي الثانيPSII في مركز التفاعل ،

 حيث يمتص الضوء الأحمر ذو طول موجة( 700nm) .

إن البنية الفراغية للنظام الضوئي غير معروفة لدى أغلب المتعلمين ، ونظرا  لبنيته المعقدة وصعوبة تفسير آلية عمله ، نحاول دراسته  باستعمال برنامج  Rastop

 و اختياره كمثال عن البروتينات الضخمة .

 

   البنية الفراغي  للنظام الضوئي الأولPS1 عند  Cyanobacteria  :

 افتح ملف النظام الضوئي (Fichier /ouvrir (1JBO ثم اتبع الخطوات التالية :

     ، Rubans /Caricatures ثم انقر على Rubans /Afficher seul انقر على

  الزر ثم النقر على  Atomes /Colorer par/Chaineوباستعمال تعليمة

  ( hétéro ) تظهر لك نافذة اكتب فيها  

 تتحصل على الشكل  المقابل:  

 يتكون النظام الضوئي الأولPS1 من جزء بروتيني يتمثل في 12سلسلة

 ببتيدية وجزء غير البروتيني المتمثل في الصبغات .

  التعرف على الأجزاء غير البروتينية :

تتمثل الأجزاء غير البروتينية في الصبغات ، للتعرف عليها انقر هنا الموجودة في النظام الضوئي الأول تعمل على استقبال الطاقة الضوئية، وهي

 موضحة في الجدول التالي:

الرمز

 الاسم
PQN   PHYLLOQUINONE

 2 جزيئة فيلوكينون
LMG   1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE 

جزيئة ثنائي سترويل أحادي قلاكتوسيل ثنائي قليسيريد
LHG   1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE 

3 جزيئات 1-2 ثنائي بالميتويل فوسفاتيديل غليسيرول
FS4   IRON/SULFUR CLUSTER 

3 جزيئات كبريتوحديدية
CL2   BETA CHLOROPHYLL A 

جزيئة بيتا كلوروفيل أ
CL1   ALPHA CHLOROPHYLL A 

95 جزيئة ألفا كلوروفيل أ
CA   CALCIUM ION

  ذرة الكلسيوم
BCR   BETA-CAROTENE

  22 جزيئة بيتا كروتين (الجزرين)

  يسمح برنامج  Rastop  بتحديد الصبغات وذلك بكتابة رمز كل صبغة في النافذة التي تظهرعند النقرعلى الزر (التي رمزها الأحرف فقط) مثلا

صبغة بيتا كاروتين  بينما الرموز التي فيها أرقام يتم تحديدها مثل بيتا كلوروفيل ا(BETA CHLOROPHYLL A)بمعرفة أرقامها بفتح Fichier de molécule  

تحديد موضع  الصبغات  المكونة  للنظام  الضوئي الأول  PSI: 

 

 

 

  موضع  بيتا كاروتين (الجزرين):

 انقر على الزر    ثم على الزر تظهر لك نافذة بعنوان

  Sélection d'atomes  اكتب عليها رمز بيتا كاروتين(BCR)  ثم انقر على

  OK ، غير نموذج العرض باستعمال الزر

تظهر صبغة الكاروتين بالنموذج الكروي .

  غير اللون بالنقر على الزر اختر اللون البرتقالي ، كما هو في الشكل.

  بنفس الطريقة تحدد موضع فيلوكينون و أيون الكلسيوم تتحصل على الشكل الموالي :