|
دراسة النظام الضوئي الأولPSI |
|
لتحديد موضع ألفا كلوروفيل أ يتطلب فتح الملف على شكل (.pdb) ، بالنقر على Fichier de molécule تسمح بإعطاء الأرقام الحقيقية لجميع الأجزاء غير البروتينية ، فتتحصل على أرقام ألفا كلوروفيل أ وهي: 1012،1013،1021،1022،1023 و1101الى غاية1801، نكتب هذه الأرقام على نافذة Sélection d'atomes بالترتيب ثم النقر على الزرOK انقر على الزر
ثم نتبع نفس الخطوات المذكورة لتحديد موضع بيتا الكلوروفيل أ CL2 ، نتحصل على الشكل الموالي: |
![]() |
|
شكل يوضح أهم الصبغات في النظام الضوئي الأولPSI |
|
|
لتحديد الجزء البروتيني اتبع الخطوات التالية : انقر على Rubans/Afficher seul لعرض البروتين بالنموذج الشريطي لتلوين الجزيئة حسب السلسلة Atomes /Colorer par/chaineثم على نلاحظ الشكل المقابل :
|
|
|
|
الرمز |
الاسم |
|
| A | PsaA_PsaB | Photosystem I psaA/psaB protein |
| B | PsaA_PsaB | Photosystem I psaA/psaB protein |
| C | Fer4 | 4Fe-4S binding domain |
| D | PsaD | PsaD |
| E | PSI_PsaE | Photosystem I reaction centre subunit IV / PsaE |
| F | PSI_PsaF | Photosystem I reaction centre subunit III |
| I | PSI_8 | Photosystem I reaction centre subunit VIII |
| J | PSI_PsaJ | Photosystem I reaction centre subunit IX / PsaJ |
| K | PSI_PSAK | Photosystem I psaG / psaK |
| L | PsaL | Photosystem I reaction centre subunit XI |
|
M |
PsaM |
Photosystem I protein M (PsaM) |
باستعمال تعليمة Commande لبرنامج Rastop نعين موضع وبنية كل السلاسل الببتيدية المكونة لمركز التفاعل، بإتباع الخطوات التالية : ثم انقر على Rubans /squelette carboné / Rubans ، ثم انقر على Editer/Commande اكتب في النافذة
(select*E)
ثم اختر العرض
بالنموذج الكروي واختر
اللون الأصفر باستعمال الزر
بنفس الطريقة نعين موضع السلاسل:(F) باللون الأزرق، (I)باللون الأخضر، (J)باللون الأحمر والسلسلة (L)اللون البني
|
|
![]() شكل لمختلف السلاسل الببتيدية المكونة لمركز التفاعل فيPSI
|
![]()