دراسة النظام  الضوئي الأولPSI

الصفحة الرئيسية

 

  تحديد موضع ألفا كلوروفيل أ( ALPHA CHLOROPHYLL A)  ( CL1) :

 لتحديد موضع ألفا كلوروفيل أ يتطلب فتح الملف على شكل (.pdb) ، بالنقر على  Fichier de molécule      

 تسمح بإعطاء الأرقام الحقيقية لجميع الأجزاء غير البروتينية ، فتتحصل على أرقام ألفا  كلوروفيل أ وهي:

 1012،1013،1021،1022،1023  و1101الى غاية1801، نكتب هذه الأرقام على نافذة  Sélection d'atomes بالترتيب  ثم النقر على الزرOK

 انقر على الزر   يظهر الكلوروفيل بالنموذج الكروي ، غير اللون بالنقر على  اختر اللون الأخضر.

  ثم نتبع نفس الخطوات المذكورة لتحديد موضع  بيتا الكلوروفيل أ CL2 ، نتحصل على الشكل الموالي:

شكل يوضح أهم الصبغات في النظام الضوئي الأولPSI

  دراسة  الجزء البروتيني في النظام الضوئي الأولPSI:

 لتحديد الجزء البروتيني اتبع الخطوات التالية :

 انقر على  Rubans/Afficher seul لعرض البروتين بالنموذج الشريطي

   لتلوين الجزيئة حسب السلسلة  Atomes /Colorer par/chaineثم على  

 نلاحظ الشكل المقابل :    

 

 

        : الجدول الموالي يوضح مختلف السلاسل الببتيدية المكونة للنظام الضوئي الأول

 

الرمز

 الاسم

A PsaA_PsaB Photosystem I psaA/psaB protein
B PsaA_PsaB Photosystem I psaA/psaB protein
C Fer4 4Fe-4S binding domain
D PsaD PsaD
E PSI_PsaE Photosystem I reaction centre subunit IV / PsaE
F PSI_PsaF Photosystem I reaction centre subunit III
I PSI_8 Photosystem I reaction centre subunit VIII
J PSI_PsaJ Photosystem I reaction centre subunit IX / PsaJ
K PSI_PSAK Photosystem I psaG / psaK
L PsaL Photosystem I reaction centre subunit XI

M

PsaM

Photosystem I protein M (PsaM)
   

تعين موضع مركز التفاعل في النظام الضوئي الأولPSI :

 باستعمال تعليمة Commande  لبرنامج Rastop نعين موضع وبنية كل السلاسل الببتيدية المكونة لمركز التفاعل، بإتباع  الخطوات التالية :

 ثم انقر على Rubans /squelette carboné / Rubans  ، ثم انقر على Editer/Commande

 اكتب في النافذة  (select*E)    ثم اختر العرض بالنموذج الكروي واختر اللون الأصفر باستعمال الزر

 بنفس الطريقة نعين موضع السلاسل:(F) باللون الأزرق، (I)باللون الأخضر، (J)باللون الأحمر والسلسلة (L)اللون البني

 

شكل لمختلف السلاسل الببتيدية المكونة لمركز التفاعل فيPSI