Rastop تعريف

أ زرار العرض Rastop تعليمات أساسيات استعمال البرنامج تحميل ملفات البروتينات تحميل البرنامج  

مواقع مكملة    Chime استعمال برنامج لوحة التحكم

الصفحة الرئيسية    

دراسة الأنظمة الضوئية الأولPSI و الثاني PSII 

 

 

  النباتات ، الطحالب وبعض البكتيريا كائنات حية ذاتية التغذية تقوم بعملية التركيب الضوئي بفضل الصانعة الخضراء، حيث تستعمل الطاقة الضوئية

   لتشكل جزيئات عضوية عن طريق النظام الضوئي الأولPSI  والنظام الضوئي الثانيPSII اللذان يعملان بصفة تعاونية تكاملية .

     دراسة النظام الضوئي الثاني  PSII عند البكتيريا :

  النظام الضوئي الثاني  PSII  عبارة عن معقد بروتيني دوره أكسدة الماء لتحرير جزيئة الـ O2 وإرجاع البلاستوكينون

  لتوضيح بنيته الفراغية نقوم  بدراسته باستعمال برنامج Rastop .

  البنية الفراغية للنظام  الضوئي الثاني  PSII:

  افتح ملف بروتين النظام الضوئي الثاني 2AXT) PSII ) :

 انقر على  Fichier /Ouvrir /2AXT ثم على الزر  وباستعمال تعليمة  Atomes /Colorer  par/ Chaine   يظهر  الشكل الموالي: 

 

 

   تحديد عدد السلاسل الببتيدية  في النظام  الضوئي الثاني  PSII :

  لمعرفة عدد السلاسل الببتيدية في النظام الضوئي الثاني نقوم بالخطوات التالية : انقر على Atomes/Colorer par/Chaine

 تظهر النتيجة كما هو في الشكل الموالي :

 

  يتكون النظام الضوئي الثاني من عدة سلاسل( 39 سلسلة ببتيدية ) .

 تحديد الأحماض الأمينية الكارهة والمحبة للماء في النظام الضوئي الثاني   PSII :

  انقر على  Propriétés  /Hydrophobes ثم على الزر ، و باستعمال الزر اختر اللون الأزرق للعرض

  بنفس الطريقة نقوم بتحديد الأحماض الأمينية المحبة للماء (اللون الأصفر) حسب ماهو موضح في الشكل .

 

  نلاحظ من الشكل أن السلاسل الكارهة للماء تكون في الجهة الخارجية للجزيئة للمنطقة المرتبطة  بغشاء التلاكوئيد ، أما الأحماض الأمينية المحبة للماء

  تكون في الجهتين المقابلة للحشوة واللمعة .       

 

تحميل ملف النظام الضوئي من الموقع