تعليمة Molécule   et Atomes

Rastop

  Molécules   :   تحتوي على مجموعة من الأوامر أهمها:                          

Information  : تشمل مجموعة من الأوامر تسمح بالتعرف على البروتين

• Molécule: بالنقر عليها تظهر نافذة تعطي معلومات بسيطة حول البروتين :

    اسم البروتين ، تصنيفه ، نوع  البنية الثانوية فيه ،عدد السلاسل المكونة له ، عدد الروابط .

•  group sélectionné: بالنقر عليها تظهر نافذة تعطي تسلسل الأحماض الأمينية

والمجموعات غير البروتينية الداخلة في تركيب البـروتين

• Menu

• Fichier

• Éditer

• Molécule

• Atomes

• Liaison

• Rubans

• Surface

• Environnement

• Fenêtre

• Aide

• Icônes

• Panneau de command

   Fichier de molécule  : إظهارنافذة تعطي ملف البروتين المدروس على  شكل  (pdb)

   Angles Phi Psi :  إظهار نافذة تعرض زوايا الدوران حول الرابطة الببتيدية لكل حمض أميني.

  Ramachandran : إظهار نافذة تعرض مخطط راما على شكل يحدد فيه قيم زوايا الدوران

 Ramachandran Printer   لكل حمض أميني plot

          Rotation : تحديد محور دوران البروتين حول واحد من المحاور الثلاث للمعلم الفضائي X, Y, Z     

        Atomes :  تضم مجموعة من الأوامر أهمها :

  Representation :  تحتوي على أوامر حول كيفية عرض ذرات البروتين و هي : 

•      Afficher: عرض الذرات المكونة للبروتين .                                                  

•     Effacer: : إلغاء عرض الذرات المكونة للبروتين.

•    Afficher seul:    إظهار الروابط المتشكلة بين الذرات فقط.

•    Sphères: إظهار الذرات المختارة بالنموذج الكروي.

•    Étoiles: إظهار الذرات المختارة بالنموذج النجمي                                            

• CPK :تلوين الذرات حسب ما اتفق عليه كميائيا.                

•  Forme :تلوين الذرات حسب المجاميع المنتمية إليها.

•    Structure :تلوين الذرات حسب نوع البنية الثانوية

•  Groupe :  تلوين الذرات حسب تقسيم المجموعات.

• Chaine : التلوين حسب عدد السلاسل الببتيدية 

•  Temperature : التلوين حسب درجة حرارة الأحماض الأمينية

• Charge      : التلوين حسب الشحنة التي تحملها الأحماض الأمينية

• Modèle :تلوين الأحماض الأمينية باللون الأبيض لاظهار موقعها مقارنة مع باقي أجزاء البروتين.

•  Alternance : التلوين حسب تعاقب الأحماض الامينية