البنية الثانوية للإنزيم الليزوزيم

الصفحة الرئيسية:   

     البنية الثانوية لإنزيم الليزوزيم :

  لمعرفة عدد التراكيب الحلزونية a والوريقية b  في إنزيم الليزوزيم انقر على Molécule /Information / Molécule

  تظهر نافذة بها معلومات حول إنزيم الليزوزيم وفيها نجد عدد التراكيب الحلزونية  a والتراكيب الوريقية b .

التراكيب الحلزونية ألفا (a):

 لعرض التراكيب الحلزونية اتبع ما يلي:

 انقر على الزر ثم على القائمة Propriétés واختر منها الأمر Hélices

      . لعرض التراكيب الحلزونية فقط  Éditer / Restreindreثم انقر على  

  نلاحظ في الشكل التراكيب الحلزونية تختلف في الطول ، ونفسر ذلك باختلاف عدد الأحماض الأمينية الموجودة في كل تركيب حلزوني.

  بإتباع نفس الطريقة يتم عرض التركيب الو ريقي(b) والمناطق البينية ،

   باختيار Propriétés /Coudes  و Propriétés / Feuillets  .

 قياس طول التركيب الحلزوني ألفا:

 قم بعرض الهيكل الكربوني بالنقر علىRubans /Squelette carbone  

  ثم باستعمال الفأرة انقر على     ثم انقر على الزر

 الحمض الأميني الأول والأخير في أحد  التراكيب الحلزونية(a) تظهر المسافة ،

 نجد الطول يقدر بـ 15.59°A كما هو موضح في الشكل المقابل:

  موقع السلاسل الجانبية :

 انقر على الزر ثم علىPropriétés /Chaine latérale لاختيار السلاسل الجانبية ثم على الزر

 ثم اختر السلسلة الرئيسية بالنقر على Propriétés /Chaine principale وغير نموذج العرض بالنقر على

 ثم انقر على :Propriétés/Hélices

  ثم علىÉditer / Restreindre  لاختيار التركيب الحلزوني.

Propriétés/  Feuillets ثم على Éditer / Restreindre لاختيار التركيب الو ريقي.

  نتحصل على النتيجة التالية :

شكل يوضح موقع السلاسل الجانبية في التركيب والوريقي                 شكل يوضح موقع السلاسل الجانبية في التركيب الحلزوني

 نلاحظ أن السلاسل الجانبية تتجه كلها للجهة الخارجية للتركيب الحلزوني والوريقي الذي يفسر دورها في تشكل الروابط الهيدروجينية والأيونية التي تعمل

 على ثبات البنيات الثانوية .

     تحديد مختلف الروابط التي تساهم في الحفاظ على ثبات بنية انزيم الليزوزيم:

  الروابط الهيدروجينية:

 لإظهار الروابط الهيدروجينية المتشكلة في التركيب  الحلزوني a والو ريقيb يتم كما يلي :

  بالنسبة  للحلزون (a):

انقر على الزر ثم على   لعرض التراكيب الحلزونية فقط على الشاشة

 انقر على Propriétés /Hélices

 Rubans/ Afficher seul/Rubans/Squelette carboné ثم على

لعرض الروابط الهيدروجينية التي تعمل على ثبات التركيب الحلزوني انقر على  

   :تتحصل على الشكل المقابل Liaisons/L.hydrogene/Type/Tirets

بالنسبة للتركيب الوريقي b:

 نطبق  الخطوات  فيما يخص التركيب الو ريقيb ،

 بالنقر على Propriétés /Feuillets  ثم على Rubans/ Caricatures

 b لعرض الوريقات  Éditer/Restreindre ثم انقر على  

 ولعرض الروابط الهيدروجينية التي تعمل على ثبات التركيب الحلزوني انقر على

 Liaisons /L.hydrogene /Type /Tirets ثم انقر على الزر  

اختر في النافذة التي تظهر Liaisons  hydrogène واختر اللون الذي تريد أن

 تعرض به الروابط الهيدروجينية .

ونتحصل على النتيجة المبينة في الشكل المقابل :

 النتيجة

حمل ملف الليزوزيم Lysozyme