|
دراسة بروتين الميوغلوبين
|
||
|
الميوغلويين هو بروتين ملون موجود في العضلات ، يعمل كمخزن للأكسجين لاستعماله عند الحاجة ، لفهم تركيبه ووظيفته ندرسه باستعمال برنامج Rastop |
||
|
|
افتح ملف بروتين الميوغلوبين Fichier /Ouvrir /1MBO للتعرف على نوع البنية الثانوية Rubans /Afficher seulثم انقر على ثم قم بتغيير لون العرض بالنقر Atomes /Colorer par /Chaine
انقر على الزر يحتوي الميوغلوبين على سلسلة ببتيدية واحدة ملتفة تحتوي على البنيات الحلزونية ألفا فقط ، بالإضافة إلى المناطق البينية ( اللون الأبيض ) . الذي يمثل الجزء البروتيني ، أما الجزء غير البر وتيني يتمثل في الهيم . |
|
|
لمعرفة عدد الأحماض الأمينية انقر على Molécule /Information/Groupe sélectionné تظهر نافذة تعطي تسلسل وعدد الأحماض الأمينية في البروتين. النتيجة: يتكون بروتين الميوغلوبين من سلسلة ببتيدية واحدة تحتوي على 153 حمض أميني . |
||
|
|
||
|
|
لتعيين موضع الهيم في بروتين الميوغلوبين قم بتغيير نموذج العرض Rubans/Squelette carboné :باتباع الخطوات التالية لتحديد
الجزء البروتيني ، أما لتعيين مجموعة الهيم انقر على ثم على Propriétés/Ligands ولتوضيحه جيدا نغير من نموذج عرضه باستعمال
الزر
|
|
|
:
تحديد
كيفية وموقع ارتباط الأكسجين
|
||
|
يمكن توضيح ذلك بمقارنة مجموعة الهيم مع مجموعة الهيم المرتبط بالأكسجين ، نقوم بفتح ملف الميوغلوبين المرتبط بالأكسجين ثم انقر على:
الزر نتحصل على الشكل الموالي : |
||
|
شكل يوضح ارتباط الأكسجين مع ذرة الحديد للهيم. |
شكل يوضح ذرة الحديد (اللون الأصفر)في الهيم |
|
|
|
||