Rastop تعريف تحميل البرنامج  تحميل ملفات البروتينات أساسيات استعمال البرنامج Rastop تعليمات أ زرار العرض

مواقع مكملة    Chime استعمال برنامج لوحة التحكم

الصفحة الرئيسية

 

دراسة بروتين الميوغلوبين

 

 

الميوغلويين هو بروتين ملون موجود في العضلات ، يعمل كمخزن للأكسجين لاستعماله عند الحاجة ، لفهم تركيبه ووظيفته ندرسه باستعمال برنامج  Rastop

 

التعرف على بنية بروتين الميوغلوبين:

 افتح ملف بروتين الميوغلوبين Fichier /Ouvrir /1MBO

     للتعرف على نوع البنية الثانوية  Rubans /Afficher seulثم انقر على

 ثم قم بتغيير لون العرض بالنقر  Atomes /Colorer par /Chaine

  انقر على الزر واكتب فيها hem ثم اختر العرض بنموذج الكرة

 يحتوي الميوغلوبين على سلسلة ببتيدية واحدة ملتفة تحتوي على

 البنيات الحلزونية ألفا فقط ، بالإضافة إلى المناطق البينية ( اللون الأبيض ) .

 الذي يمثل الجزء البروتيني ، أما الجزء غير البر وتيني يتمثل في الهيم .

   تعيين عدد الأحماض الأمينية المتدخلة في تركيب  الميوغلوبين:

لمعرفة عدد الأحماض الأمينية انقر على Molécule /Information/Groupe sélectionné

 تظهر نافذة  تعطي تسلسل وعدد الأحماض الأمينية في البروتين.

    النتيجة:

 يتكون بروتين الميوغلوبين من سلسلة ببتيدية واحدة تحتوي على 153 حمض أميني .

   تحديد موضع الهيم (hem)  في بروتين الميوغلوبين :

 

 

       لتعيين موضع الهيم في بروتين الميوغلوبين قم بتغيير نموذج العرض

Rubans/Squelette carboné :باتباع الخطوات التالية

لتحديد الجزء البروتيني ، أما لتعيين مجموعة الهيم انقر على

  ثم على Propriétés/Ligands  ولتوضيحه جيدا نغير من نموذج عرضه

 باستعمال الزر   كما هو موضح في الشكل المقابل:     

 

     

:  تحديد  كيفية وموقع  ارتباط الأكسجين 

 

يمكن توضيح ذلك بمقارنة مجموعة الهيم مع مجموعة الهيم المرتبط بالأكسجين ، نقوم بفتح ملف  الميوغلوبين المرتبط بالأكسجين ثم انقر على:

الزر ثم على Propriétés/Ligands ، لعرض مجموعة الهيم فقط على الشاشة انقر على Editer /Restreindre

 نتحصل على الشكل الموالي :

 

 

 

 

 

 

 

 

 شكل يوضح ارتباط الأكسجين مع ذرة الحديد للهيم.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

                              شكل يوضح ذرة الحديد (اللون الأصفر)في الهيم