Rastop أساسيات استعمال
تمثيل الهيكل الكربوني وتحديد موقع الرابطة الببتيدية في البروتين:
fichier /ouvrir/ ( 2hiu ) افتح ملف البروتين مثلا الأنسولين
انقر الزر
ثم على /Propriétés /Squelette carboné
Éditer /Restreindre/Afficher وباستعمال
ثم الزر
يسمح الشكل بملاحظة كيفية تسلسل الأحماض الأمينية دون السلاسل
الجانبية .
تحديد الرابطة الببتيدية :
تتشكل الرابطة الببتيدية بين COOH حمض أميني و NH2 الحمض
الأميني الموالي ولتوضحها قم بالخطوات التالية :
انقر على الزر
ثم على الزر
تظهر النافذة ،
اكتب رقمين لحمضين أمينين متتاليين (مثلا 6،7)
انقر على OK وباستعمال Éditer /Restreindre
: تتحصل على الشكل المقابل
ثم النقر على الزر
اختيار ذرة أو حمض أميني وتميزه عن المكونات الأخرى :
يمكن اختيار إحدى الأحماض الأمينية خاصة الأحماض الأمينية الأساسية
وتمييزها عن المكونات الأخرى للبروتين ، افتح ملف (1HEW )
انقر على الزر
ثم انقر على(Éléments /C-cys) ،
وباستعمال الزر
يظهر لك بالنموذج الكروي .
إذا أردت عرض Cys فقط على النافذة انقر على :
Éditer/Restreindre ثم على الزر
، وكبر الشكل
باستعمال Trans/zoom لاحظ الشكل
اتبع هذه الخطوات لتختار أي ذرة من البروتين (C، O ،N ...)
بكتابة رمز الذرة على نافذة
تتحصل على الشكلين المواليين:
الذرة باللون الأزرق تمثل الأزوت
الذرة باللون الأحمر تمثل الأكسجين
توضيح بنية الأحماض الأمينية :
تتكون الأحماض الأمينية من مجموعتين وظيفتين NH2 و COOH
وذرة الهيدروجينH وسلسلة الجانبية R ، انقر على
(Éléments/(A-Asn ثم على Éditer/Restreindre
تتحصل على الشكل المقابل
واستعمال الزر
يمثل الشكل بنية الحمض الأميني أسبرجين Asn