Rastop أساسيات استعمال

 

 

الصفحة الرئيسية

 

   تمثيل الهيكل الكربوني وتحديد موقع الرابطة الببتيدية  في البروتين:

fichier /ouvrir/ ( 2hiu  ) افتح ملف البروتين مثلا الأنسولين

انقر الزر  ثم على  /Propriétés /Squelette carboné

Éditer /Restreindre/Afficher وباستعمال ثم الزر 

يسمح الشكل بملاحظة كيفية تسلسل الأحماض الأمينية دون السلاسل

الجانبية .  

 

 تحديد الرابطة الببتيدية :

 تتشكل الرابطة الببتيدية  بين  COOH حمض أميني و NH2 الحمض

 الأميني الموالي ولتوضحها قم بالخطوات التالية :

انقر على الزر ثم على الزر تظهر النافذة ،

 اكتب رقمين  لحمضين أمينين متتاليين (مثلا 6،7)

 

 

 

 

 انقر على   OK وباستعمال  Éditer /Restreindre  

  : تتحصل على الشكل المقابل ثم النقر على الزر

    اختيار ذرة أو حمض أميني وتميزه عن المكونات الأخرى :

يمكن اختيار إحدى الأحماض الأمينية خاصة الأحماض الأمينية الأساسية

وتمييزها عن المكونات الأخرى للبروتين ، افتح ملف (1HEW )

انقر على الزر   ثم انقر على(Éléments /C-cys) ،      

 وباستعمال الزر يظهر لك  بالنموذج الكروي . 

إذا أردت عرض  Cys  فقط على النافذة انقر على :

 Éditer/Restreindre  ثم على الزر  ، وكبر الشكل

 باستعمال Trans/zoom لاحظ الشكل

اتبع هذه الخطوات لتختار أي ذرة من البروتين (C، O ،N ...)

بكتابة رمز الذرة على نافذة تتحصل على الشكلين المواليين:

                    

 

                     الذرة باللون الأزرق تمثل الأزوت   

 

الذرة باللون الأحمر تمثل الأكسجين                         

                        

    توضيح بنية الأحماض الأمينية :

تتكون الأحماض الأمينية من مجموعتين وظيفتين NH2 و COOH    

 وذرة  الهيدروجينH  وسلسلة الجانبية R ، انقر على

(Éléments/(A-Asn ثم على Éditer/Restreindre    

تتحصل على الشكل المقابل  واستعمال الزر

يمثل الشكل بنية الحمض الأميني أسبرجين Asn