Rastop أساسيات استعمال

   الصفحة الرئيسية

    عرض البنية الثانوية للبروتين:

 نقصد بالبنية الثانوية للبروتين أنها تراكيب متكررة للأحماض الأمينية المتجاورة على طول السلسلة الببتيدية. أهمها التركيب الحلزوني ألفا (a)

 والتركيب الو ريقي بيتا(b) ولتوضيحها نقوم بـالخطوات التالية:

   التركيب الحلزوني(a)

 بعد فتح البروتين انقر على Propriétés/Hélices ثم على الزر

وانقر على Éditer/Restreindre ، بعدها استعمل التعليمة

     يظهر لك الشكل المقابل  Rubans/Afficher seul

 إذا أردت إظهار التركيب الحلزوني(a) بنماذج مختلفة قم بالنقر على:

  Rubans/Afficher seul واستعمل تعليمة

    ثم انقر على Atomes / Colorer par/ Structure

   Rubans/Brins تتحصل على الشكل الموالي، ثم غير العرض إلى

 Squelette carbonné وبعدها Trans تتحصل على

الأشكال الموالية:

                        Brins                     

Squelette carboné  

   Trans            

  الروابط الهيدروجينية:

 كيف يحافظ البروتين على تركيبه الحلزوني( a) ؟

 يتم المحافظة على هذا التركيب بالوجود الروابط الهيدروجينية نعرضها بإتباع الخطوات التالية : انقر على Rubans/Trans ثم استعمل تعليمة

 Atomes / Colorer par/CPK، ثم انقر على Liaison/ L-Hydrogène/Afficher لعرض الروابط الهيدروجينية على شكل نقاط ، وإذا أردت زيادة

 سمكها انقر على Liaison/ L-Hydrogène/Type/Bâtonnets 

تظهر نافذة RasTop تكتب فيها سمك الرابطة      

 الهيدروجينية حيث يكون العدد(0-250)                     

ثم انقر على الأمر الذي تريده  مثلا اخترت الأمر كتابة

 الرقم(20)  يظهر الشكل الموالي:

تظهر الروابط الهيدروجينية بشكل موازي لمحور الحلزون ألفا ما بين

 الحمض الأميني الأول و الحمض الأميني الرابع

حسب القاعدة  (n + 4)