تحميل ملفات البروتينات
الصفحة الرئيسية
الخطوة الثانية
توجد الملفات الأصلية للبروتينات في بنك خاص يسمى بنك البروتينات ( Protéine Data Bank ( PDB، وكل بروتين له رمز واحد خاص به فمعرفته تسهل الحصول على ملفات البروتينات ، ونظرا لكثرة عدد البروتينات التي توجد في بنك PDB ( أكثر من 43633 ) قمنا بوضع بعض ملفات البروتينات في هذا الموقع لتسهيل تحميلها من طرف المتعلم ، بالنقر على اسم البروتينات المدونة في الجدول الموالي تظهر لك نافذة Téléchargement de Fichierانقر علىEnregistrer ليتم حفظ الملف في المجلد الذي اخترته ، في هذه الحالة يتم تحميله بشكل مضغوط يتطلب فتحه توفر برنامج Win RAR أو Win Zip ليتم استخلاصه بشكل ملف عادي .
ملاحظة : يستحسن وضع ملفات البروتينات التي تم حملها في نفس المجلد الذي تم فيه وضع برنامج راستوب .
تصنيفه
رمزه الموافق
اسم البروتين
إنزيم مرتبط بالركيزة
1HEW
إنزيم الليزوزيم مرتبط بـNAG6
1LZS
إنزيم كربوكسيبتيداز
3CPA
هرمون الأنسولين (الإنسان)
2hiu
بروتين دموي
1A6G
بروتين دموي
2DN1
2DN3
2DN2
بروتين مناعي
IGGTOTAL
IGG - LYS البروتينات الناقلة
1SUK
1WPE
الأنظمة الضوئية
1JBO
2AXT
ATP Synthas
1C17
1E79
قناة البوتاسيوم
1BL8
مستقبل الاسيتيل كولين
2BG9
أما إذا أردت الحصول على ملفات أخرى من البروتينات اتصل بالموقع الأصلي http://www.rcsb.org/pdb ، الذي يحتوي على ملفات لمعلومات عن بنية ثلاثية الإبعاد للجزيئات الكبيرة ( الحموض النووية،البروتينات....)، للحصول على ملف البروتين اتبع الخطوات التالية:
بعد الدخول إلى الموقع تظهر لك نافذة قم بإدخال رمز البروتين في مستطيل البحث.
انقر على الأمر Search تظهر نافذة تحتوي على ملفات خاصة للبروتين.
اختر ملف البروتين الذي تريد دراسته حسب الركيزة و المصدر .
انقر على الأمر Download ثم اختر شكل الملف على صورة PDB .
تظهر نافذة صغيرة لتحميل ملف البروتين اختر المجلد الذي تريد أن تحفظه فيه ثم انقر على OK .
ماذا يعني ملف PDB ؟
هو ملف نصي يصف وضعية الذرات المكونة للجزيئة في أبعادها الثلاثة منها : البروتينات ، الأحماض النووية و الجزيئات البسيطة كالأحماض الأمينية و الماء...
الانتقال إلى الخطوة (3) : أساسيات استعمال البرنامج .